ثم وجهن له بعد ذلك تهمة الكسب غير المشروع بخصوص صادرات الغاز مع اسرائيل لكن حكم له بالراءة منها في العام 2014.
ومن الجدير بالذكر ان حسين سالم مساهم رئيسي في غاز شرق المتوسط وهي شركة مصرية وكانت قد حامت حولها شبهات بخصوص بيع الغاز لاسرائيلوعدة دول اخرى باسعار تفاضلية مما فوت على مصر تحقيق ايرادات ومكاسب من التصدير.
ثم وقع اتفاق  تصالح في العام 2016  مع الحكومة المصرية وتم استرداد مبلغ 5.3 مليار جنيه منه ومن أفراد اسرته لادارة الكسب غير المشروع.
واخيرا كان قد قدم تظلم على الحكم بالتحفظ على أمواله وقد تم قبول تظلمه.